bioinf

0 18 flashcards dawidfleischer1

start learning

download mp3 print play test yourself

Question		Answer
Programy do wykonywania przyrównań wielu sekwencji start learning		T-COFFEE, MAFFT, MUSCLE
Formaty zapisu drzew filogenetycznych start learning		Newick, Nexus
Modele substytucji nukleotydowych i aminokwasowych start learning		GTR, JTT, TN93, HKY, VT
Programy do tworzenia drzew filogenetycznych start learning		MrBayes, Mega, IQ-Tree
Programy do wykonywania przyrównań par sekwencji start learning		lalign, bl2seq, needle, water
Macierze punktacji par aminokwasów stosowane w przyrównaniach sekwencji start learning		PAM, BLOSUM, GONNET
Programy do poszukiwania homologów start learning		PSI-BLAST, FASTX, TBLASTN
Metody służące do poszukiwania i konstruowania drzew filogenetycznych start learning		MP, ML, ME, NJ
Programy do rozpoznawania sekwencji kodujących białko start learning		FGESB, HMMgene, GeneID, GeneMark
Białkowe bazy danych start learning		PIR, SWISS-PROT, PDB
Bazy zawierające informacje o motywach i domenach białek start learning		Prosite, Pfam, CDD, InterPro
Programy przewidujące regiony promotorowe i regulatorowe start learning		BPROM, FindTerm, TSSG, POLYAH
Programy do przewidywania lokalizacji subkomórkowej białek start learning		SignalP, TargetP, DeepLoc, signalHMM
Programy przewidujące modyfikacje potranslacyjne białek start learning		Net-coś
Programy służące do rozpoznawania alfa-helikalnych regionów translonowych w białkach start learning		TMHMM, TMpred, Phobius, CCTOP
Formaty zapisu sekwencji start learning		FASTA, GenBank, FASTQ
Bazy danych sekwencji nukleotydowych start learning		GenBank, EMBL, DDBJ
Programy służące do modelowania homologicznego struktur białkowych start learning		Modeller, Swiss-Model, 3D-JIGSAW

Create flashcards

You must sign in to write a comment