→ Wejściówka 2 → Start Learning / Download MP3 Flashcards

Question		Answer
Ludzie hetero-czy mono zygotami i jak długi jest ich łańcuch genowy start learning		są heterozygotami oraz mają dłigośc 1/500 pz
SNP start learning		single nucleotide polymorphism
CNV start learning		copy number variation
HGP start learning		human genome project
pozbawienie zwierzęcia doświadczalnego określonego genu start learning		knockout genowy
genomika porównawcza start learning		porównawcza analiza różnych genotypów
proteomika start learning		wiedza o zespołach białek wytwarzanych przez komórki, tkanki, narządy
transkryptomika start learning		badania regulacji ekspresji genów na poziomie transkrypcji
Rekombinacja DNA in vitro jest możliwa dzięki? start learning		enzymom restrykcyjnym Endonukleazy
Gdzie znaleziono Endonukleazy? start learning		Znalezione jedynie w komórkach bakterii i sinic
Czemu zapobiegają Endonukleazy u bakterii i sinic? start learning		Zapobiegają włączenie obcego DNA do genomu bakterii
Jaką długość ma sekwencja zwykle rozpoznawana przez Endonukleaze? start learning		specyficzna sekwencja dwuniciowego DNA ma zwykle długość 4-8 par zasad
Aktywność „star” Endonukleaz co oznacza? start learning		Oznacza to ze trzeba zwrócić uwagę na warunki oznaczone przez producenta gdyż b uzyskać oczekiwany efekt trzeba przeprowadzić reakcje w warunkach podanych przez producenta
w jakiej długości światła są wykrywane zasady aromatyczne start learning		światło o długości 260 nm
w jakiej długości światła są wykrywane Białka start learning		światło o długości 280 nm
Od czego zależy współczynnik ekstrakcji start learning		od długości badanej cząsteczki
Absorpcja największa jest dla czego a najmniejsza dla czego start learning		Absorpcja największa dla nukleotydów a najmniejsza dla dsDNA
Hipochromizm start learning		Mniej barw
DsDNA o stęż 1mg/ml - A260 start learning		20
RNA i ssDNA - A260 start learning		25
Co ma wyższy współczynnik ekstrakcji puryny czy pirymidyny start learning		Puryny mają wyższy współczynnik ekstrakcji niż pirymidyny
Co powoduje topnienie (ogrzewanie) start learning		40% wzrost absorbancji
Co powoduje szybkie ochładzanie? start learning		minimalny spadek absorbancji
Co powoduje wolne ochładzanie? start learning		absorbancja bez zmian
Co daje Wektor start learning		zdolność do izolacji od gospodarza i replikacji
Co daje wektor Fag λ start learning		klonowania większych fragmentów
Co daje wektor H13 start learning		klonowania fragmentów jednoniciowych
Co to kosmid start learning		plazmid + fag λ
Episomalne plazmidy start learning		wektory dla drożdży
Plazmid Ti start learning		dla roślin
Biblioteki DNA start learning		zbiory sklonowanych przypadkowo fragmentów genomu DNA/cDNA
Mapowanie restrykcyjne start learning		analiza fragmentów klonu po cięciu restryktazami
Komórki kompetentne start learning		czyli takie, które są zdolne do przyjęcia obcego DNA przez działanie na nie jonami Ca2+, Mn2+ i Rb2+
Transformanty start learning		przechowywane są najpierw w płynnej pożywce z antybiotykiem (selekcja) a następnie zamrażane z glicerolem (nie tworzą się kryształy) → tzw. zapas glicerolowi
Co pozwala odnaleźć polarność klonów cDNA start learning		Rejon kodujący
W czym są umieszczone polarne startery? start learning		Są umieszczone w postaci oligo(dT)
Polarne startery są komplementarne do? start learning		poliA
W klonach genomowych jakie mamy geny? start learning		Nie wiadomo od razu gdyż obecność genów nie jest oczywista
W klonowany genomach wiemy o jego polarności? start learning		Nie za bardzo gdyż polarność nie jest oczywista w klonowanych genach
Hybrydyzacja i mapowanie pozwana nam określić? start learning		Organizowanie klonowanych genów
na podstawie czego przygotowuje się Sondy start learning		na podstawie Southerna części sekwencji cDNA
Co można wykazać na podstawie Sondy przygotowanej metodą Southerna? start learning		Można określić która część klonu genomowego zawiera sekwencje komplementarne do sond.
Mapowanie za pomocą nukleazy S1: start learning		Identyfikacja końca 3’/5’ - hybrydyzacja transkryptu z dłuższym antysensownym fragmentem na jednym końcu Usuwanie fragmentów jednoniciowych - poddanie hybryd działaniu nukleazy S1 Określanie wielkości pozostałych dwuniciowych fragmentów - elektroforeza
Wydłużanie startera start learning		Starter jest wydłużany przez polimerazę dopóki nie osiągnie końca matrycy Następnie dochodzi do oddysocjowania polimerazy Długość wydłużonego fragmentu wskazuje na koniec 5’ matrycy
Retardacja żelowa start learning		Zmieszanie ekstraktu białkowego ze znakowanym fragmentem DNA Rozdział mieszaniny w niedenaturującym żelu poliakryloamidowym Ujawniają się kompleksy DNA-białko w postaci prążków retardacyjnych (opóźnionych)
Technika „odcisku stopy” z udziałem DNazy I start learning		„Odcisk stopy” białka związanego specyficznie z sekwencją DNA Może zostać ujawniony poprzez działanie małą ilością DNazy I na mieszaninę DNA i białka poddaje się analizie elektroforetycznej
Geny reporterowe start learning		Łatwo wykrywalne geny,
W jakim celu przyłącza się geny reporterowe? start learning		W celu zidentyfikowania funkcji jakiegoś promotora
Po przyłączeniu geny reporterowego co się bada start learning		Bada się ilość powstałego produktu białkowego
Jak określimy ważność poszczególnych sekwencji? start learning		poprzez dokonywanie progresywnych delecji DNA z jednego końca
Co pozwala uzyskać jednokierunkowe delecje? start learning		Egzonukleaza III - Usuwa kolejne nukleotydy w kierunku 3’→5’, gdzie koniec 3’ w dwuniciowy DNA jest cofnięty w stosunku do 5’
łączenie fragmentów sekwencji start learning		Powstałe cząsteczki poddaje się ligacji
Mutageneza ukierunkowana? start learning		Uzyskiwanie zmian jednego lub kilku nukleotydów w określonym miejscu sekwencji
Jak przeprowadza się mutagenezę start learning		W tym celu wykorzystuje się przyłączanie mutagennego startera i syntezę komplementarnego DNA z użyciem polimerazy DNA
Mutageneza dawniej start learning		Dawniej - jednoniciowe matryce przygotowane z użyciem wektorów M13
Mutageneza obecnie start learning		Obecnie - matryce otrzymane metodą PCR
Cel mutagenezy metodą PCR start learning		amplifikacja fragmentów DNA od strony 5’ lub 3’
Zastosowanie klonowania start learning		Wytwarzanie: zrekombinowanego białka, GMO, „odcisku DNA”, przygotowywanie zestawów diagnostycznych, terapie genowe
Jak powstaje zrekombinowane białko start learning		może być produkowane dzięki wprowadzeniu genu rzadko występującego białka do plazmidu i poddanie ekspresji w bakteriach, gdy krytycznym etapem jest modyfikacja potranslacyjna, gen może być poddany ekspresji w kom. eukariotycznych
Jak powstaje GMO start learning		powstaje poprzez wprowadzenie obcy gen do komórki, z której można zregenerować cały organizm
Jak powstaje „Odcisk DNA” start learning		hybrydyzacja, przeniesionego metodą Southerna, genomowego DNA z sądami, które rozpoznają proste powtórzenia nukleotydów prowadzi to do otrzymania obrazu, który jest unikatowy dla danego osobnika i może być stosowany do jego identyfikacji.
Terapia genowa - próby skorygowania genetycznych zaburzeń przez wprowadzenie do organizmu pacjenta prawidłowej kopii genu start learning		próby skorygowania genetycznych zaburzeń przez wprowadzenie do organizmu pacjenta prawidłowej kopii genu
Czystość DNA start learning		A260/A280 = 1,8 -czyste DNA A260/A280 < 1,8 -zanieczyszczone białkiem A260/A280 > 1,8 -zanieczyszczone RNA
Wirowanie izopikniczne start learning		To inaczej równowagowe wirowanie w gradiencie stężeń chlorku cezu
Co umożliwia Wirowanie izopikniczne start learning		Umożliwia analizę DNA i jego oczyszczanie
Co z RNA i białkami podczas wirowania izopiknicznego? start learning		RNA w dół, białka flotują = unoszą się
elektroforeza mikrokapilarna start learning		z wykorzystaniem macierzy
elektroforeza kapilarna start learning		w wolnym buforze, niewielkie cząsteczki, w cienkiej kapilarze kwarcowej
elektroforeza w żelu poliakrydynowym start learning		5-1000 pz (gRTPCR)
elektroforeza W żelu agarozowym start learning		0,1 -20 kpz
elektroforeza W polu pulsacyjnym start learning		20kpz - 10 Mpz (oddziela cząsteczki wielkości 100 kpz!)
Choroba Takahary = alaktazemia start learning		Gen kontrolujący syntezę katalazy - krótkie ramię chromosomu 11 - 11p13
Mechanizm Choroba Takahary = alaktazemia start learning		redukuje aktywność katalazy
objawy Choroba Takahary = alaktazemia start learning		Owrzodzenia śluzówek jamy ustnej, podudzi oraz wczesne wypadanie zębów
gdzie najczęsciej występuje Choroba Takahary = alaktazemia start learning		Najwyższa częstość występowania mutacji w Japonii
Dziedziczenie Choroba Takahary = alaktazemia start learning		autosomalnie recysywnie
Wrażliwość na chlorek suksametonium - start learning		zwiotczenie mięśni, efekt szybki ale tez szybko znika(za hydrolizę sukcynylocholiny odpowiedzialnej za objawy odpowiada cholinoesteraza- jej gen na 3 chromosomie i tam mutacja)
Hipertermia złośliwa start learning		przez leki znieczulenia ogólnego: antyestetyki, zwioty, glikozydy naparstnicy. Wzrasta napięcie mięśni prążkowanych, drżenie mięśniowe, tachykardia, wzrost temp. ciała (1C w ciągu 5 min) Mutacja 19q13.1
Alaktazemia start learning		gen 11p13, autosomalna recesywna
Metabolizm alkoholu etylowego- 2 enzymy start learning		dehydrogenaza alkoholowa ADH (chromosom 4) i dehydrogenaza aldehydowa ALDH (1-chromosom 9, 2-chromosom 12) Najczęściej u Azjatów
Porfirie start learning		porfiryny to prekursory hemu i składniki enzymów: wątrobowe i erytropoetyczne. Deficyty enzymów biorących udział w przemianach porfiryn. OPP=> wątrobowe. Autosomalnie dominująco.
Krzywica oporna na wit D3 start learning		gen VDR dominująco w sprzężeniu z chromosomem X
Niedobór dehydrogenazy glukozo-6-fosforanowej start learning		chromosom X
Niedobór alfa-1-antytrypsyny start learning		gen PI, chromosom 14,
Niedobór paraoksonazy start learning		gen PON1 na chromosomie 7 sprzężony z genem CFTR
Hemochromatoza start learning		gen HFE na chromosomie 6, autosomalnie recesywnie
Hipolaktazja start learning		3 allele na chromosomie 3
Fenyloketonuria start learning		autosomalnie recesywnie, 12q24.1
Co wywołuje ostrą porfirię? start learning		Leki (barbiturany, sulfonamidy, przeciwbólowe, antykoncepcyjne, antybiotyki, alkaloidy sporyszu, etanol), infekcje, głodzenie, duży wysiłek fizyczny.
Formy enolowe/ketonowe start learning		W pH obojętnym - ketonowa, w zasadowym - enolowa
Co to sonikacja? start learning		Działanie ultradźwiękiem o dużej intensywności na DNA co prowadzi do uszkodzenia DNA i zmniejszenia jego lepkości.
Podział zasad. start learning		Puryny: adenina i guanina (2 piescienie) Pirymidyny: cytozyna, tymina, uracyl (1 pierścień)
Liza alkaliczna (element minizolacji plazmidów) start learning		Metoda oczyszczania plazmidowego DNA z chromosomowego DNA i innych
Plazmidy start learning		Autonomiczne, pozachromosomowe elementy genetyczne W postaci kolistych/liniowych cząsteczek DNA
PCR - łańcuchowa reakcja polimerazy start learning		Do amplifikacji sekwencji DNA Z użyciem pary oligonukleotydowych starterów Każdy jest komplementarny do jednego końca docelowej sekwencji DNA Termostabilna polimeraza DNA powoduje wzajemne wydłużanie się ku sobie starterów
Etapy PCR start learning		Etapy: denaturacja (95°C), przyłączenie startera (55°C), polimeryzacja (72°C) Elementy wymagane: matryca, startery, bufory, enzym, Mg2+, dNTP
Startery PCR start learning		Startery: para oligonukleotydów o długości 18-30 pz i podobnej zawartości G+C
Enzymy PCR start learning		termostabilna (odporna na denaturację) polimeraza DNA np. Taq

Wejściówka 2

You must sign in to write a comment

More