→ Moje 4 → Start Learning / Download MP3 Flashcards

Question		Answer
Podaj przykłady metody badania interakcji DNA/Białko start learning		EMSA, genetic footprinting
Oznaczanie ilości transkryptu można wykonać metodami: start learning		DOT-BLOT i NORTHERNBLOT
W tej metodzie białka nie są rozdzielane przy użyciu elektroforezy a bezpośrednio nanoszone na membranę a następnie wykrywane za pomocą przeciwciał. start learning		DOT-BLOT
Ile sekwencji zawiera 1 Mikromacierz (Chip) DNA? start learning		97 000
Ile pól zawierają mikromacierze (chipy) DNA? start learning		47pól (każde jeszcze 45x45) razem 97 000 fragmentow sekwencji
Do czego najczęściej wykorzystywane są mikromacierze (chip) DNA? start learning		Do badania ekspresji genów
Co to jest efekt hyperchromiczny? start learning		ssDNA ma większą adsorbancję w 260nm niż dsDNA
Wiedza (z grubsza) o położeniu genów na chromosomie wyrażona jest w: start learning		częstości rekombinacji (cM)
Metoda która służy do oznaczania miejsc genów na chromosomie to...: start learning		Mapowanie genomów
Metody oznaczania miejsc genów na chromosomie (WYMIEŃ): start learning		-mapowanie genetyczne (mejotyczne) -mapowanie fizyczne: FISH, STS, mapowanie klonów, mapowanie restrykcyjne
Mapowanie regionów na chromosomach z użyciem sond fluorescencyjnych to: start learning		FISH
Mapowanie genomów któe wykorzystuje krótkie unikalne sekwencje zwykle amplifikowanie w PCR to: start learning		STS
Wymień organizmy których sekwencje genomów poznano: start learning		E. coli, S. cerevisiae, człowiek, Drosophila melanogaster
Ile % różnic jest między sekwencjami ludzkimi? start learning		0,1 - 0,2 % różnic (a w sumie 3-6mln różnic w skali genomu)
Ile % genomu szympansa i człoiwieka jest identyczne? start learning		98%
Ile % genomu człowieka nie posiada przypisanej funkcji? start learning		97%
Który chromosom był zsekwencjonowany jako pierwszy? start learning		22
Linie komórkowe z rodzin składających się z co najmniej 2 dziadków, 4 rodziców, 6 dzieci to: start learning		CEPH
Ile jest znanych monoallelicznych chorób genetycznych? start learning		17 000
Informacje o monoallelicznych chorobach genetycznych są dostępne w jakiej bazie danych? start learning		OMIM
Choroba Huntingtona dotyczy którego chromosomu? start learning		4
Mukowiscydoza dotyczy którego chromosomu? start learning		7
Anemia sierpowata którego chromosomu dotyczy? start learning		11
Retinoblastoma dotyczy którego chromosomu? start learning		13
Choroba Alzheimera dotyczy którego chromosomu? start learning		21
Zastosowania techniki RFLP: start learning		różnicowanie organizmów wykazywanie powiązań rodzinnych w kryminalistyce do idenytyfikacji osób potwierdzanie ojcostwa
Minisatelity to inaczej: start learning		VNTRs
Minisatelity jakiej są długości? start learning		10-100pz
Satelity które są umieszczone nierównomiernie w genomie (najwięcej jest ich na końcach chromosomów) to mini czy mikro? start learning		minisatelity
Startery które okalają mikrosatelity to start learning		markery STS
Metody badania proteomu to: start learning		- elektroforeza dwuwymiarowa 2D -spektrometria masowa -krystalografia rengenowska
Rozproszone po całym genomie pojedyncze różnice w nukleotydach, bez presji selekcyjnej na zdolności reprodukcyjne ale mogące zaburzać ekspresję genów to: start learning		SNP
Zmienności ilości powtórzeń genów lub ich części to: start learning		CNV (copy numer variations)
Zespół etycznych i prawnych problemów związanych z poznaniem genomów np. dyskryminacji genetycznej (długość życia, podatność na choroby) to: start learning		ELSI
Białka których synteza przebiega bezpośrednio od Met kodowanej przez cDNA to: start learning		białka natywne
Białka zawierające dodatkowe peptydy na N- lub C-Końcu to: start learning		białka fuzyjne
Do ekspresji białek fuzyjnych wykorzystywani są tacy gospodarze jak: start learning		E. coli, ssaki, drożdze, Bakulowirusy
Narzędzia wykorzystywane do ekspresji białek fuzyjnych to: start learning		mutageneza, klonowanie fuzyjne, interakcje białko-białko, wysokoprzepustowość
Wymień metki: start learning		HIS-tag, Strep-tag, Flag-tag, myc-tag, GST-tag
Wektor który pozwala na wprowadzenie do bakterii i efektywną ekspresję białka, który zawiera gen oporności na kanamycynę to: start learning		wektor pET28a
Bakulowirusy posiadają jaki kwas nukleinowy? start learning		dsDNA, kolisty
Jaki kapsyd zawierają Bakulowirusy? start learning		w formie laseczki
Co najczęściej atakują Bakulowirusy? start learning		W naturze najczęściej motyle (larwy motyli łuskoskrzydłych) - ćmy i jedwabniki
Bakulowirusy posiadają otoczkę zbudowaną z: start learning		białka polihedryny
w Bakulowirusach gen polihedryny został czym zastąpiony? start learning		miejscem insercji genu egzogennego
Wektor wahadłowy to np. start learning		Bacmid
Co to jest Bacmid? start learning		Jes to zrekombinowane DNA koliste bakulowirusa wykorzystujące replikon mini-F (plazmidu płciowego E. coli) do replikacji w bakteriach jak i miejsce attTn7 jako miejsce klonowania obcego genu przez transpozycję wykorzystującą transpozon Tn7
Wymień ssacze linie komórkowe: start learning		HeLa, HepG2, CHO
Co to są muteiny? start learning		To białka otrzymane na drodze inż. gen. Ich sekwencja różni się od sekwencji natywnej.
Wymień farmaceutyki wytwarzane na drodze inż, gen start learning		insulina, hormon wzrostu, DNaza, alfa-interferon
Co to jest chymozyna? start learning		Chymozyna, inaczej podpuszczka, proteolityczny enzym prowadzący koagulację kazeiny mleka. Źródła: cielęta, krowy, świnie, Grzyby mikroskopijne: RHIZOMUCOR
Co to jest rBST start learning		rekombinowana Somatotropina wołowa
Do diagnostyki jakich infekcji jest wykorzystywana inż, gen? start learning		HIV, HPV, Gruźlica, Borelioza
Do diagnostyki jakich chorób o podłożu genetycznym przyczyniła się inż.? start learning		mukowiscydoza pląsawica Huntingtona Dystrofia mięśniowa Duchenne'a
Wymień choroby dziedziczące się autosomalnie dominująco: start learning		choroba Huntingtona, stwardnienie guzowate, rodzinna polipowatość jelita grubego
Wymień choroby dziedziczące się autosomalnie recesywnie: start learning		alkaptonuria, choroba Wilsona, anemia sierpowata
Wymień Choroby dziedziczne sprzężone z chromosomem X: start learning		dystrofia mięśniowa Duchenne'a, hemofilia Ai B Zespół łamliwego chromosomu
Wymień autosomalne abberacje chromosomowe: start learning		Trisomia 13 - zespół Patau Trisomia 18 - zespół Edwardsa Trisomia 21 - zespół Downa
Wymień aberracje chromosomowe dotyczące chromosomów płciowych: start learning		Brakujący Y - zespół Turnera Dodatkowy X (XXX) - superkobieta Dodatkowy X (XXY) - zespół Klinefeltera Dodatkowy Y (XYY) - zespół Jacobsa
Wymień strukturalne defekty w abberacjach: start learning		delecja duplikacja inwersja translokacja
W mukowiscydozie jak często występuje zmutowany allel? start learning		1 na 2-/25 osób
70% przypadków w mukowiscydozie jest spowodowane: start learning		mutacją punktową, delecją 3pz co skutkuje delecją fenyloalaniny
Pląsawica Huntingtona dotyczy jakich powtórzeń? start learning		trzynukleotydowych (sekw. CAG) normalnie do 34 powtórzeń więcej niż 42 powtórzenia indukują powstanie choroby
W dystrofii mięśniowej Duchenne'a ma miejsce uszkodzenie genu kodującego jakie białko? start learning		dystrofinę - łączy ona włókna aktynowe i bierze udział w przekazywaniu sygnałów
Drogi wprowadzania transgenów in vivo to np: start learning		insercja transgenu do liposomów lub wektorów i dostarczenie do tkanki np do płuc przez aerozol
Drogi wprowadzania transgenów ex vivo to: start learning		przemieszczenie zmodyfikowanych komórek do organizmu
Systemy wirusowe wprowadzania transgenów to: start learning		retrowirusy adenowirusy wirusy AAV
Systemy nie-wirusowe wprowadzania transgenów to: start learning		Nagi DNA Liposomy Lipopleksy
Interferencja RNA jest wyzwalana przez: start learning		dsRNA
W interferencji RNA jakie białko rozpoznaje dsRNA i tnie je na fragmenty? start learning		DICER i degraduje dsRNA na fragmenty 21 nt
Mikrosatelity to inaczej: start learning		STR
Jak dzielą się metody transgenizacji roślin? start learning		Na fizyczne i biologiczne
Wymień fizyczne metody transgenizacji roślin: start learning		mikroiniekcja, działko genowe, elektroporacja, fuzja protoplastów
Wymień biologiczne metody transgenizacji roślin? start learning		wykorzystanie bakterii Agrobacterium tumefaciens - wywołujące w naturze guzowatość korzeni
Plazmidy Ti służące jako wektory do transgenezy roślin mają: start learning		CON - gen transferu koniugacyjnego Geny T-DNA - powodujące rozrosty nowotworowe tkanki roślinnej Geny katabolizmu opin - stanowią pożywke dla bakterii, nieprzyswalajne dla roślin (pochodne aminokwasów) OKTOPINY i NOPALINY VIR - rozpoznanie uszkodzonych tkanek roślinnych (25 genów) uaktywnienie pozostałych czynników wirulencji
Region T-DNA w plazmidzie Ti zawiera geny: start learning		tms tml tmr nos (nopalins) ocs (octopins)
Sztuczny bakteryjny chromosom pozwalający przenoszenie z Agrobacterium do roślin stosunkowo dużych fragmentów DNA to: start learning		BIBAC
BIBAC - binarny sztuczny chromosom bakteryjny, umożliwia przenoszenie z Agrobacterium do rośliny jak dużych fragmentów DNA? start learning		ok 150 tysięcy pz
Przykłady transgenicznych roślin: start learning		złoty ryż, Flavr-Savr - pomidory soja, kukurydza, bawełna, rzepak
organizm zbudowany z komórek różniących się genetycznie to start learning		CHIMERA
Przykłady myszy transgenicznych: start learning		SUPER-MYSZ (szczurzy hormon wzrostu) MYSZ-CF - zapada na mukowiscydozę onko-mysz - zapada na nowotwory sutka mysz - tramp (nowotwór prostaty)
Delikatna liza enzymatyczna ściany komórkowej podczas LIZY KOMÓREK I UWOLNIENIA KWASÓW NUKLEINOWYCH pod wpływem jakich środkow? start learning		lizozym pektynazy celulazy
Liza detergentowa błon komórkowych podczas IZOLACJI KWASÓW NUKL. pod wpływem jakich środków? start learning		TX100, Tween20, SDS
Separacja kwasów nukleinowych od pozostaych składników - jakie stosujemy do tego środki? start learning		ekstrakcja mieszaniną fenol/chloroform + precypitacja etanolem (izopropanolem)
Jeśli podczas izolacji kwasów nukleinowych chcemy uzyskać DNA stosujemy start learning		trawienie RNazą A
Jeśli podczas izolacji kwasów nukleinowych chcemy uzyskać RNA stosujemy start learning		DNazę I
Jak rozkładają się warstwy (OD GÓRY) podczas ultrawirowania w gradiencie chlorku cezu? start learning		białka chromosom plazmid RNA
Izolacja RNA metodą Chomczyńskiego - jakie wykorzystujemy składniki start learning		izolacja całkowitego RNA za pomocą roztworu IZOTIOCJANIAITU GUANIDYNY i kwaśnego fenolu (ph 4)/chloroformu
Podczas metody Chomczyńskiego jaką fazę poddajemy wirowaniu w celu otrzymania RNA? start learning		fazę wodną która jest na samej górze
Izolacja mRNA metodą Chromatografii powinowactwa wykorzystuje jakie składniki? start learning		oligo-dT
W ocenie stężenia kwasów nukleinowych metoda fluorescencyjna wykorzystuje jakie substancje: start learning		Bromek etydyny PicoGreen
Izotopy radioaktywne wykorzystywane do znakowania kwasów nukleinowych to start learning		3H 14C 35S 32P
Nieradioaktywne substancje wykorzystywane do znakowania kwasów nukleinowych to: start learning		biotyna DIG
Metoda sekwencjonowania sangera-coulsona polega na włączaniu: start learning		ddNTPS dideoksynukleotydów
Pirosekwencjonowanie jakie związki wykorzystuje: start learning		polimeraza sulfurylaza ATP lucyferaza apyraza APS lucyferyna
W pirosekwencjonowaniu jaki związek odpowiada za świecenie? start learning		lucyferyna
W pirosekwencjonowaniu za co odpowiada apryzaza? start learning		usuwa dNTPy i APT przygotowując do następnej rundy
W pirosekwencjonowaniu co mierzy ilość wyemitowanego światła? start learning		Kamera CCD
ION-TORRENT start learning		Ion Torrent posiada miliony małych wgłębień, które wypełnia się badaną próbką DNA - do tego zadania wykorzystuje się urządzenie Ion Personal Genome Machine. Następnie badany jest wpływ polimerazy na nukletydy. W dużym uproszczeniu układ posiada ogromną macierz czujników, sprawdzających zmianę pH spowodowaną uwalnianiem jonów wodoru.

moje 4

You must sign in to write a comment

More