→ Biologia Molekularna Krótkie Wykłady Sekcja D → Start Learning / Download MP3 Flashcards

Question		Answer
escherichia coli jaki ma genom start learning		genom prokariotyczny
jak wygląda DNA E. coli start learning		pojedyncza koliście zamknięta cząsteczka DNA
jaka długość ma DNA E. coli start learning		4.6 miliona par zasad
W co jest upakowane DNA E. coli start learning		w nukleoid
jakie stężenie ma nukleoid E. coli start learning		(duże) 30-50 mg*ml-1
z ilu domen składa się nukleoid E. coli start learning		50-100 domen
kształt nukleidu e. coli start learning		domeny przytwierdzone do białka przytwierdzonego do błony komórkowej widok gwiazdy
Chromosom E. coli całościowo jest jaki? start learning		Superhelikalny ∆Lk? Ln(n) =0.06
Co niepozwala rotować się DNA E. coli start learning		Przyłaczenie DNA do białkowo-błonowego rusztowania
Najczęstsze białka wiążące DNA? start learning		HU i H-NS
Białko HU jest? start learning		-małe; zasadowe; z ładunkiem dodatnim; w postaci dimeru
jak białko HU wiąże DNA? start learning		Wiąże owijając wokół własnej cząsteczki
Inna nazwa białka H-NS start learning		wcześniejsza nazwa białko H1
Białko H-NS jest? start learning		monomerem; ma obojętny ładunek;
Białko H-NS preferuje wiązanie się z DNA jakim? start learning		Niespecyficznym przede wszystkim miejsca zagięć helisy DNA
Angielska nazwa H-NS oraz HU (zwyczajowa) start learning		Białko podobne do histonów - Histone-like proteins
na co ma wpływ białka H-NS oraz HU start learning		na kondensacje DNA
Do czego jest potrzebna kondensacja DNA start learning		Jest niezbędna by upakować DNA w nukleotyd i utrzymaniu struktury superhelikalnej chromosomu
co znaczy ∆Lk/Lk(-3) start learning		ze mamy jeden skręt superhelikalny na każde 17 skrętów helisy, w tym połowa skrętów jest wymuszona przez trwałe owiniecie wokół białek HU
inne ważne czynniki w organizowaniu domen DNA start learning		białka, RNA, mRNA, polimeraza RNA
homolog białka HU? start learning		białka IHF (integration host factor- integralny czynnik gospodarza)
Ile razy genom prokariota może być mniejszy od genomu eukariota start learning		Tysiące
DNA eukariota jest upakowany między innymi? start learning		w chromosomach
Ile chromosomów ma człowiek start learning		46
jaką ma długość DNA w chromosomach start learning		około kilku cm liniowej cząsteczki
jak wielkie jest jądro Eukariota start learning		zbliżone do wielkości bakterii
Jak duże stężenie DNA może być start learning		nawet 200 mg*ml(-1)
Co to chromatyna start learning		to kompleks DNA i białek (kompleks nukleoproteinowy) tworzący stopień upakowania DNA
ile procent masy chromatyny to białko start learning		50%
w jakiej fazie najbardziej jest skondensowany chromosom start learning		w metafazie
w jakiej fazie chromosom jest mocno rozproszony start learning		w interfazie
Co to histon start learning		to białka wchodzące w skład chromatyny
na jakie klasy dzielimy histony? start learning		H2A, H2B, H3 i H4 to histony rdzeniowe oraz H1
co to histony rdzeniowe start learning		to histon klasy H2A, H2B, H3 i H4
jakie są histony rdzeniowe w porównaniu do H1 start learning		małe białka(mniejsze niż H1), mają masę od 10 do 20 kDa
histony są start learning		mocno dodatnie ładunkiem (ułatwia to silne wiązania z ujemnym DNA), 20 do 30% to zasadowe aminokwasy lizyna oraz arganina
jaką masę mają histony H1 start learning		23 kDa
ilość histonów H1 jest mniej więcej połowa ilości innych histonów start learning		ilość histonów H1 jest mniej więcej połowa ilości innych histonów
Nukeaza to? start learning		Enzym hydrolizujący wiązanie fosfodiestrowe w kwasach nukleinowych
Egzonukleazy uwalniają? start learning		pojedyńczę nukleotydy z końców nici kwasów nukleinowych
Endonukleazy rozcinają? start learning		rozcinają wnętrza wiązań fosfodiestrowych
Co powoduje potraktowanie chromatyny nukleazą z mikrokoków? start learning		Powoduje do izolacji fragmentu DNA o różnej wielkości będącą wielokrotnością około 200 pz.
200 pz jest z czym zasocjowane start learning		jest zasocjowane histonowym rdzeniem (okręcone wokół rdzenia) z histonów H2a, H2B, H3 i H4 czyli histonów rdzeniowych
Po pierwszym wycięciu chromatyny nukleazą z mikrokoków i pozostawieniu w dalszym trawieniu nukleazą co się stanie start learning		zostanie struktura zawierająca fragment 146 pz która jest silnie zasocjowana z histonowym oktamerem (histonami rdzeniowymi) wykazuje ona podobieństwo strukturalne niezależnie od miejsca z którego została wycięta
na histonowym rdzeniu oktamerowym mamy ile pz start learning		mamy 146 pz owijające się 1.8 lewoskrętnego zwoju tworząc superhelikalność
Co to nukleosom start learning		nukleosom to rdzeń histonowy (oktamerowy) z nawiniętym DNA w 1.8 skrętu czyli z 146 pz
H1 gdzie się przyczepia? start learning		Przyczepia się do nukleosomu stabilizując miejsce wejścia oraz wyjścia DNA nawijając 20 pz co daje ładnie 166 pz
Czemu odpowiada 166 pz nawiniętych na rdzeń nukleosomu oraz na histon H1 start learning		odpowiada 2 pełnym skrętom
Czemu H1 jest większe? start learning		bo ma dodatkowy ogon "C-końcowy" który odpowiada za stabilność DNA pomiędzy nukleosomami
Czy histon H1 może być zamieniony na inny? start learning		W niektórych typach komórek może być zamieniony na swój skrajny wariant na histon H5 który nie ulega transkrypcji.
Co to sznur koralików? start learning		to nukleosony wraz z DNA łacznikowym które jest cienką nicią DNA która uzupełnia do 200 pz powtarzających się podczas doświadczenia z nukleazą
ule wynosi standardowo DNA łącznikowe? start learning		Zwykle około 55pz ale może mieć od kilku do nawet 100 pz
czy histon H1 zwiększa organizacje "koralików"? start learning		Tak wraz z wzrostem stężenia soli aż do powstania włókien średnicy 30nm
Jak nazywa się lewostronna zawinięta helisa wyższego rzędu? start learning		jest to solenoid
na jeden obrót w solenoidzie przypada ile nukleosomów? start learning		6 nukleosomów
Długość DNA w pętli eukariota to? start learning		100 pz w przybliżeniu tyle co u prokariota jednak w chromosomie eukariotycznym mamy znacznie więcej pętli
przez co są końce pętli unieruchomione? start learning		są unieruchomione przez rusztowanie białkowe lub matriks jądrowy (czyli kompleksy białkowe)
Jak wyglądają wymiary wyższych struktur uporządkowania DNA? start learning		tworzą się włókna o średnicy 30 nm oraz z nich pętle o szerokości 300nm
w jakiej fazie chromosom jest najbardziej skondensowany? start learning		w mitozie
przed czym chroni chromosom duże skondensowanie? start learning		Przed rozerwaniem DNA
Przez co są rozdzielane chromosomy? start learning		Przez wrzeciono mitotyczne.
Co mamy na końcach chromosomów oraz DNA start learning		Telomery
Centromer to start learning		Ograniczony rejon gdzie łącza się dwie chromatydy siostrzane tworząc chromosom
co to kinetochor start learning		kompleks białkowy przyłączający się do mikrotubul wrzeciona mitotycznego
Co rozdzielają mikrotubule start learning		Rozdzielają chromatydy podczas anafazy
długość centromeru u drożdży? start learning		88pz bogatych w AT
Centromer Eukariota ograniczony jest start learning		satelitarnym DNA (sekwencjami powtarzającymi się)
Co zawiera telomer? start learning		zawiera setki kopi sekfencji (5-TTAGGG-3 u człowieka)
Co syntetyzuje telomeraza start learning		sekfencje (5-TTAGGG-3)
co to telomeraza? start learning		jest to rodzaj rybonukleoproteiny
Co zabezpiecza telomer start learning		końcówkę chromosomu
Jak uchronić telomer przed skracaniem? start learning		należy syntetyzować niezależnie telomer
co zachodzi podczas interfazy start learning		transkrypcja genów na chromosomach oraz replikacja DNA
jak długo trwa faza S (interfaza) start learning		większość czasu
jaką strukturę przyjmują chromosomy podczas interfazy? start learning		przyjmują strukturę bardziej rozproszoną nie da się ich rozróżnić
co to heterohromatyna start learning		jest to część chromatyny w interfazie jaka dalej jest mocno skondensowana jednak nie aż tak silnie jak w metafazie
z czego składa się heterochromatyna start learning		z satelitarnego DNA jest transkrypcyjnie nieaktywna przykładem jest chromosom X u samic ssaków.
gdzie widzimy heterochromatynę w jądrze pod mikroskopem start learning		widzimy ją na obrzeżach jądra jako ciemne prążki
Co to Euchromatyna start learning		pozostała część chromatyny inna niż heterochromatyna
Co się dzieje z Euchromatyną aktywną transkrypcyjnie start learning		może być bardziej rozproszona już rozwinięta z pętli 30nm aż do sznura koralików czy nawet odwinięta z nukleosomów by łatwo przyłączać czynniki transkrypcyjne
Jaka cześć euchromatyny jest aktywna transkrypcyjnie? start learning		10%
gdzie znajduje się gen? start learning		w miejscach aktywnych transkrypcyjnie
jak mapuje się miejsca aktywne transkrypcyjnie? start learning		szuka się miejsc z nadwrazliwościa na DNazę I czyli deoksyrybonukleazę I
Co robi DNaza I start learning		rozcina DNA
sygnał do odpowiedniego poziomu upakowania chromosomu w miejscach genów ulegających ekspresji jest? start learning		metylacja C-5 cytozyny występująca w sekfencji 5-CG-3
powszechnie nazwa metylacji C - 5 cytozyny? start learning		metylacja CpG
gdzie znajdują się niezmetylowane wyspy CpG? start learning		W obrębie genów aktywnych transkrypcyjnie
Jak długie są niezmetylowane wyspy CpG? start learning		2000 pz
co się dzieje z zmetylowaną sekwencją CpG? start learning		szybko mutuje do TpG z powodu spontanicznej deaminacji 5'-metylocytozyny do tyminy
przykład występowania histonu H5? start learning		w krwinkach czerwonych ptaków
aktywnej transkrypcji chromatyny towazyszy start learning		acetylacja reszty lizyny w N-końcowych domenach
co towarzyszy kondensacji chromosomów? start learning		fosforylacja histonu H1
unikatowe sekwencje DNA start learning		hybrydyzują wolniej, są często aktywne transkrypcyjnie
tandemowe zespoły genów start learning		to takie jakie maja sekwencje transkrypcyjną wielokrotnie powtórzona. np geny transkrybujące RNA czy DNA
sekwencje SINES start learning		krótkie elementy rozproszone od kilkuset pz
sekwencje LINES start learning		od tysiąca do 5 tysięcy pz (długie elementy rozproszone
najpopularniejsze LINES u człowieka start learning		sekfencja Alu
długość sekwencji Alu? start learning		300pz
jak często występuje Alu? start learning		300000 a 500000 razy się powtarza z 80% 90% procentową powtarzalnością
długość DNA satelitarnego? start learning		od 2 do 20-30 pz
podział DNA sateliarnego? start learning		minisatelity oraz mikrosatelity
minisatelity start learning		tandemowe powtórzenia o zmiennej liczbie powtórzeń VNTR
mikrosatelity start learning		proste powtórzenia tandemowe STR
gdzie znajdziemy minisatelity VNRT start learning		najczęściej w pobliżu końca chromosomów
Gdzie znajdziemy mikrosatelity? (SRT) start learning		wzdłuż całego chromosomu
do czego stosujemy minisatelity start learning		do zbadania odcisku DNA np w celu sprawdzeniu pokrewieństwa
sekwencja polimorficzna start learning		to sekwencja inna niż na chromosomie homologicznym lub jeśli występuje inna sekwencja niż standardowa u danego gatunku
SNP start learning		polimorfizm pojedynczych nukleotydów
SSLP start learning		polimorfizm długości pojedynczej sekwencji
RFLP start learning		polimorfizm długości fragmentów restrykcyjnych
dogmat biologii molekularnej start learning		Z DNA powstaje RNA które tworzy białka
polimeraza RNA co robi start learning		transkrybuje gen poczynając od promotora a kończąc na terminatorowej sekwencji
RNA kodujący kilka białek to start learning		RNA polistronicowy
translacja RNA na białko odbywa się w? start learning		rybosomach
miejsce RNA gdzie koduje kilka białek nazywane jest? start learning		Operonem
RNA jakie jest tłumaczone w Rybosomach to start learning		mRNA (messege RNA)
kodon startu to start learning		kodon inicjatorowy zwykle AUG
tRNA mają funkcje? start learning		transportują aminokwasy do rybosomów w celu tworzenia białek (tRNA - transport RNA)
jak wygląda ekspresja genów u prokariota start learning		polimeraza RNA transkrybuje gen następnie przez transkrypcje mRNA i przenoszony do rybosomu tam udział tRNA które donosi aminokwasy. Zwykle sekfencja kodonu inicjatora to AUG przy końcu 5' a terminator jest na końcu 3'
pre-mRNA start learning		RNA jakie jest transkrybowane w jądrze komórkowym i syntetyzowane przez polimeraze II
pre - mRNA jest transkrybowane przez którą po start learning		polimeraze II
zwykle u eukariota jest kodowane tylko jedno białko start learning		miejsca transkrypcyjne są monostronicowe
kapowanie start learning		czyli dodanie do pre-mRNA ogonu poli (A) na końcu 3' co zwiększa stabilność
introny start learning		sekwencję przerywające kodowanie białka
splicing start learning		usuwanie intronów z pre-mRNA i powstanie eksonów
snRNA start learning		małe jąderkowe RNA
snRNA powstaje? start learning		w wyniku splicingu

biologia molekularna krótkie wykłady sekcja D

You must sign in to write a comment

More