→ BIOLOGIA MOLEKULARNA 2 → Start Learning / Download MP3 Flashcards

Question		Answer
Białka, światło? start learning		Światło o długośi 280 nm
Absorpcja gdzie najwieksza start learning		dla nukleotydów
Absorpcja gdzie najmniejsza start learning		dla dsDNA
Od czego zależy współczynnik ekstyncji'? start learning		Od długości badanej cząsteczki
co znaczy hipochromizm start learning		mniej barwny
dsDNA o stęż 1mg/ml ile a? start learning		a260 = 20
RNA i ssDNA ile a? start learning		a260- 25
co ma wyższy współczynnik ekstynkcji, puryny czy pirymidyny? start learning		puryny
Topnienie (ogrzewanie) - absorbancja? start learning		40% wzrost absorbancji
Szybkie ochładzanie - absorbancja? start learning		Minimalny spadek absorbancji
Wolne ochładzanie - absorbancja? start learning		Absorbancja bez zmian
Wektor, jaka zdolność start learning		Zdolność do izolacji od gospodara i replikacji
Fag alfa, zdolność? start learning		Zdolność do klonowania większych fragmentów
h13 zdolność? start learning		zdolność do klonowanie fragmentów jednoniciowych
co to kosmid? start learning		plazmid + fag alfa
Episomalne plazmidy są wektorami dla? start learning		Są wektorami dla drożdzy
Plazmid Ti wektor dla? start learning		Roślin
Biblioteki DNA start learning		zbiory sklonowanych przypadkowo fragmentów genomu DNA/cDNA
Mapowanie restrykcyjne start learning		analiza fragmentów klonu po cięciu restryktazami
Komórki kompetentne start learning		są zdolne do przyjęcia obcego DNA przez działanie na nie jonami Ca2+, Mn2+, Rb2+
Transformanty, gdzie najpierw są przechowywane? start learning		w płynnej pożywce z antybiotykiem (selekcja)
Gdzie po selekcji są przechowywane transformanty? start learning		Są zamrażane z glicerolem (nie tworzą się kryształy), tzw. zapas glicerolowy
Co robi fosfotaza alkaliczna? start learning		ten enzym usuwa reszty fosforanowe z 5'
co robi polimeraza DNA I? start learning		ten enzym odpowiada za syntezez nici z 5->3
co to Fragment klenowa? start learning		ten enzym to pochodna polimerazy DNA I, brak własciowsci egzonukleazy
Nukleaza fasoli mung co to start learning		ten enzym trawi jednoniciowe fragmenty naprzeciw pęknięcia nici
ODWROTNA TRANSKRYPTAZA start learning		Zależna od RNA, synteza DNA komplementarnego do RNA w kierunku 3->5 od startera z 3'OH
czego wymaga odwrotna transkryptaza? start learning		trifosforanów deoksyrybonukelozydów
co robi RNAza A? start learning		ten enzym trawi RNA
co robi RNAza H? start learning		ten enzym trawi RNA hybrydy DNA-RNA
Terminalna transferaza co robi start learning		ten eznym dodaje nukleotydy do końca 3' a jak GTP to powtaje ogon oligoG
A260/a280 = 1,8 a czystość dna start learning		Czyste DNA
a260/280 < 1,8 a czystosc DNA start learning		zanieszczone białkiem
a260/280 > 1,8 a czystosc DNA start learning		zanieszczyczone RNA
co to Wirowanie izopikniczne start learning		równowagowe wirowanie w gradiencie stężeń chlorku cezu
Co umożliwia wirowanie izopikniczne? start learning		Umożliwia analizę DNA i jego oczyszczanie
Gęstość DNA w wirowaniu izopiknicznym? start learning		1,7g/cm3
Co robi RNA i białka w wirowaniu izopiknicznym? start learning		RNA w dół, białka flotują(unoszą się)
Jaki barwnik w elektroforezie? start learning		różowo/pomarańczowy bromek etydyyny
jak zachodzi elektroforeza start learning		od KATODY (-) do ANODY (+)
Od czego zależy szybkość migracji kolistego DNA w elektroforezie? start learning		od warunków
Napięcie w elektroforezie start learning		5-8 V/cm3
Gdzie najlepiej widoczna elektroforeza? start learning		w RNA
Jakie środowisko zachodzenia elektroforezy? start learning		W żelu agarozowym (bromek etydyny) lub poliakrydynowym (AgNO3/SYBR)
co to metoda gRTPCR? start learning		real time, analiza ilości produktów w czasie rzeczywistym
czego używa się w gRTPCR? start learning		SYBR
cechy SYBR start learning		nietoksyczny i silnie wiążacy DNA
Kiedy zachodzi analiza w gRTPCR? start learning		analiza w czasie trawienia
czego analiza w gRTPCR? start learning		Analiza polimorfizmu pojedynczych nukleotydów
Co jest znakowane w gRTPCR? start learning		nukleotydy i sondy
Elektroforeza mikrokapilarna start learning		z wykorzystaniem macierzy
Elektroforeza kapilarna start learning		w wolnym buforze, niewielkie cząsteczki, z cienkiej kapilarze kwarcowej
W żelu poliakrydynowym elektoforeza (PZ) start learning		5-1000 pz (gRTPCR)
w żelu agarozowym elektroforeza start learning		0,1 - 20 kpz
w polu pulsacyjnym elektroforeza start learning		20kpz - 10 Mpz, oddziela cząsteczki wielkości 100kpz
Choroba takahary, inna nazwa start learning		alaktazemia
jaki gen, choroba Takahary? start learning		Gen kontrolujący syntezę katalazy, krótkie ramie chromosomu 11 (11p13)
jak dziedziczona alaktazemia? start learning		autosomalnie recesywnie
Na czym polega alaktazemia? start learning		Redukcja aktywnośći katalazy
gdzie najczęściej alaktazemia? start learning		Najwyższa częstość występowania mutacji w Japonii
Objawy alaktazemii start learning		Owrzodzenie śluzówek jamy ustnej, podudzi, oraz wczesne wypadanie zębów
Cholinoesteraza start learning		gen na 3 chromosomie i tam mutacja
Wrażliwość na chlorek suksametonium, objawy? start learning		zwiotczenie mięśni, efekt szybki ale też szybko zanika. (za objawy odpowiada hydroliza sukcynylocholiny)
za hydrolizę sukcynylocholiny odpowiedzialna jest? start learning		cholinoesteraza
Jak dziedziczona hipertermia złośliwa? start learning		autosomalnie dominująco
Przez co wywoływana hipertermia złośliwa start learning		leki znieczulenia ogólnego: antystetyki wziewne, dożylne, leki zwiotczające, glikozydy naprastnicy
Objawy hipertemia złośliwa start learning		wzrasta napięcie mięsni prązkowanych, drzenie mięsniowe, pojawa się tachykardia i wzrost temperatury ciała(1 stopien w ciagu 5 min)
Mutacja genu 19q13.1 start learning		Koduje receptor rianodynowy uwalniajacy wapń z retikulum do cytoplazmy ->hipertermia złośliwa
Jak dziedziczona hipertermia złośliwa? start learning		autosomalnie dominująco
Alaktazemia jaki gen start learning		11p13
jak dziedziczona alaktazemia? start learning		autosomalna recesywna
Metaboizm alkoholu etylowego, jakie enzymy? start learning		Dehydrogenaza alkoholowa ADH i dehydrogenaza aldehydowa ALDH
gdzie dehydrogenaza alkoholowa ADH? start learning		chromosom 4
gdzie dehydrogenaza aldehydowa ALDH? start learning		1-chromosom 9, 2-chromosom 12
Porifiryny start learning		prekursory hemu i składniki enzymów
na jakie dzielimy porifiryny start learning		na wątrobowe i erytropoetyczne
Porfirie, na czym polega start learning		Deficyt enzymów biorących udział w przemianach porfiryn
Jak dziedziczone porfirie? start learning		Autosomalnie dominująco
Krzywica odporna na wit D3, jaki gen? start learning		gen VDR dominująco w sprzężeniu z chromosomem X
Niedobór dehydrogenaza glukozo-6-fosforanowej, jaki chromosom start learning		chromosom X
niedobór alfa-1-antytrypsyny, jaki gen i chromosom start learning		Gen PI, chromosom 14
niedobór paraoksonazy, gen + chromosm start learning		gen PON1 na chromosomie 7 sprzeżony z genem CFTR
Hemochromatoza, jaki gen start learning		gen HFE na chromosomie 6, autosomalnie recesywnie
hipolaktazja, jaki gen start learning		3 allele na chromosomie 3
fenyloketonuria, jaki gen start learning		12q24.1
Jak dziedziczona fenyloketonuria? start learning		autosomalnie recesywnie
Co wywołuje ostrą porfirie? start learning		Lek, infekcje, głodzenie, duży wysiłek fizycnzy
Jakie leki wywołują ostrą porfifrie? start learning		barbiturany, sulfonamidy, przeciwbólowe, antykoncepcyjne, antybiotyki, alkaloidy sporyszu, etanolu,
Kiedy forma enolowa? start learning		w pH zasadowym
Kiedy forma ketonowa? start learning		w ph obojętnym
Co to sonikacja? start learning		Działanie ultradźwiękiem o dużej intensywności na DNA
Do czego prowadzi sonikacja? start learning		Do uszkodzenia DNA i zmniejszenia jego lepkośći
Podział zasad start learning		Puryny i pirymidyny
Puryny start learning		adenina i guanina (2 pierścienie)
Pirymidyny start learning		cytozyna, tymina, uracyl (1 pierścien)
Co to liza alkaliczna? start learning		Metoda oczyszczania plazmidowego DNA z chromosowego DNA i innych
Plazmidy start learning		Autonomiczne, pozachromosome elementy genetyczne
W jakiej postaci występują Plazmidy? start learning		w postaci kolistych/liniowych cząsteczek DNA
gdzie wystąpują Plazmidy? start learning		u prokariotów i niektórych eukariotów
Jaka zdolnosc maja plazmidy? start learning		Zdolność do trwałego utrzymywania się i replikowania w komórce
Plazmidy a chromosomy gospodarza start learning		Są odrębne od chromosomów gospodrza
Jaką struktuę tworzą plazmidy? start learning		CCC-DNA
co robi CCC-DNA? start learning		wykazuje negatywne superskręcenie
Jakie plazmidy nie tworzą struktury CCC-DNA? start learning		Plazmidy izolowane z hypertermofilnych Archaea, u których jest pozytywne superskręcenie cz. DNA
wielkość plazmidów start learning		od 1000 pz do 1,7 Mpz
Gdzie najmniejsze plazmidy? start learning		U Heamophilus somnus, Mycoplasma i Helicobacter pylori
Gdzie największe plazmidy? start learning		u Rhizobium
Gen kodujący białko (plazmidy) start learning		30 kDa - 1 kpzC
Co zawierają plazmidy? start learning		Region początku replikacji
Jakie geny często zawierają plazmidy? start learning		odporności, np. gen bla / ampr
Co robi gen bla/ampr? start learning		Koduje beta-laktamaze, która rozkłada antybiotyki penicylowe
NORTHERN BLOT start learning		dla transferu rozdzielonego elektroforetycznie DNA
SOUTHERNBLOT start learning		osmoza do wymuszenia węrdrówki soli z pociąganiem DNA ze sobą
WESTERN BLOT start learning		dla transferu białka
EASTERN BLOT start learning		dla transferu białek po ich rozdziale w elektroforezie dwukierunkowej
DNA/RNA w środowisku kwasowym start learning		hydroliza
DNA/RNA w środowisku lżej kwasowym (3-4) start learning		hydroliza wiązan glikozydowych, kwas apurynowy
DNA/RNA w środowisku zasadowym start learning		denaturacja (RNA i DNA), hydroliza (RNA, bo ma 2-OH')
Co jest bardziej podatne na hydrolize? DNA czy RNA? start learning		ZAWSZE RNA
Multipleks PCR start learning		ampliflikacja równoczesna
Nested-PCR start learning		wewnętrzna/gniazdowa, gdy mało matryc
RT-PCR start learning		przepisanie sekwencji z MRNA składającego się z samych eksonów na cDNA - stwierdzanie obecności określonych transkryptów
STS-PCR start learning		Umożliwia indentyfikację poszczególnych loci dzięki amplifikacji fragmentu DNA pomiędzy parą starterów o znanej sekwencji
STS – ile pz? start learning		200-300 pz
Zagęszczanie map genetycznych, jaka metoda start learning		STS-PCR
Poszukiwanie sprzężen z cechami genotypowymi, jaka metoda start learning		STS-PCR
do uporządkowania bibiloteki genomowej w KONTIGI, jaka metoda? start learning		STS-PCR
RACE-PCR start learning		szybka amplifikacja końców Cdna, poznanie dokładnej sekwencji jednego z końców
ASA=PASA=ASP=ARMS start learning		amplifikacja alleo-specyficzna, wykrywa polimorfizm alleli i mutacji punktowych
ASO start learning		połączenie hybrydyzacji i PCR
co robi sonda w ASO? start learning		sonda rozponzacje allel prawidłowy/zmutowany
OLA start learning		badanie ligacji oligonukleotydów, połączenie PCR i ligacji DNA
REP-PCR start learning		wykorzystanie sekwencji repetytywnych
AS-PCR start learning		asymetryczne PCR, amplifikowana tylko 1 nić, na 3' fluorochrom
I-PCR start learning		odwrócona PCR, DNA oskrzydla znana sekwencje
PCR in situ start learning		z udziałem znakowanych nukleotydów, czuła i kosztowna
RAPD-PCR start learning		losowa amplifikacja polimorficznego DNA, umożliwia jednoczesną detekcję polimorfizmu wielu loci w całym genomie
Jaka ilość DNA wyjściowego w RAPD-PCr? start learning		mała
W jakiej metodzie PCR wykyrywane loci mają dominujący charakter? start learning		w RAPD-PCR
W jakiej metodzie nie można odróżnić homozygot od heterozygot? start learning		w RAPD-PCR, bo wizualizacja tylko jednego z dwóch alleli
Badanie jakiego materiału jest zalecane przy RAPD-PCR? start learning		Haploidalnego materiału
W jakiej metodzie badanie zróżnicowania DNA jądrowego między osobnikami i populacjami? start learning		RAPD-PCR
Jaka metoda umożliwia szybkie określenie liczby chromatyny X i Y w jądrach interfazowych? start learning		FISH
FISH umożliwia zlokalizowanie jakich sekwencji DNA? start learning		nieswoistych sekwencji DNA bezporśrednio w materiale genetycznym
Jakie zmiany bada FISH? start learning		Zmiany ilościowe w liczbie i strukturze chromosomów
Metoda oparta na fish start learning		cytogenetyka interfazalna
Do czego hybrydyzacja typu northern? start learning		do analizy RNA i procesu transkrypcji poszczególnych genów
Ustalanie, które geny uległy transkrypcji w badanych tkankach - jaka metoda start learning		Hybrydyzacja typu northern
Ustalanie, które geny uległy transkrypcji na danym etapie rozwoju - jaka metoda? start learning		hybrydyzacja typu northern
Poznanie czego jest możliwe dzięki hybrydzacji typu northern? start learning		Poznanie długości RNA i intensywność jego transkrybcji
Hybrydyzacja RNA-DNA jaka metoda start learning		northern
Hybrydyzacja DNA-DNA jaka metoda start learning		southern
HGP start learning		projekt poznania ludzkiego genomu
knockout start learning		pozbawienie zwierzęcia doświadczalnego określonego typu
genomika porównawcza start learning		porównawcza analiza różnych genotypów
proteomika start learning		wiedza o zespolach bialek wytwarzanych przez komórki, tkanki, narządy
transkryptomika start learning		badanie regulacji ekspresji genów na poziome transkrypcji
gdzie znalezione enzymy restrykcyjne? start learning		jedynie w komórkach bakterii i sinic
Enzym restrykcyjny jakie sekwencje rozpoznaje? start learning		Speficzyne sekwencje dwuniciowego DNA o długości 4-8 par zasad
Aktywność STAR start learning		niespecyficznośćenzymów restrykcyjnych w niektórych warunkach
kiedy aktywność star? start learning		kiedy trawienie przeprowadza sięwinnych warunkach niż optymalnie
Enzym EcoRI a zmienione warunki start learning		zmienione warunki mogę uniemożliwić wykrycie struktury GAATTC, którą normalnie rozpoznaje
co to optymalne warunki trawienia start learning		odpowiednie Ph, stęzenie jonów magnezu
Co pozostawiją enzymy restrykcyjne? start learning		Końce tępe i lepkie w cząsteczce
Gdy obie nici rozcięte są naprzeciwko siebie równolegle, powstają start learning		tępe końce
Gdy jednoniciowe sekwencje wystepujace na obu koncach sa przeciete niesymetrycznie, powstaja start learning		lepkie konce
Restryktazy czworkowe start learning		rozpoznaja sekwencje DNA co 256pz
Restryktazy szostkowe start learning		Rozpoznaja sekwencje DNA co 4096 pz
Izoschizomery start learning		enzymy pochodzące z różnych szczepów bakterii, ale rozpoznające te same sekwencje DNA
Egzonukleazy start learning		umożliwiaja odpowiednią modyfikacje koncow we fragmentach DNA
polimerazy start learning		odpowiedzialne za amplifikację odpowiednich odcinkow DNA

BIOLOGIA MOLEKULARNA 2

You must sign in to write a comment

More